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耀杰不凡丨第二刊：“肛拭子”頻頻上熱門？伯杰醫療邀你一起知其所以然

近日，采集“肛拭子樣本”用于新冠篩查的新聞成為大家熱議的焦點，事件的起因是1月20日

2022-02-21


“耀杰不凡”致敬幕后抗疫英雄推文解讀活動


第二刊：“肛拭子”頻頻上熱門？伯杰醫療邀你一起知其所以然


近日，采集“肛拭子樣本”用于新冠篩查的新聞成為大家熱議的焦點，事件的起因是1月20日，北京新冠防控新聞發布會介紹，其已對大興某新發病例所在學校全體學生、教職工等全部進行鼻咽拭子、口咽拭子、肛拭子及血清檢測。

那么問題來了，此次北京大興為什么在篩查中增加了“肛拭子”檢測？其實，有關樣本類型檢出率這一議題，早先便有眾多學者對其進行過討論。2020年8月公布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第八版)》中也明確表示，可以在糞便、尿液中可分離到新冠病毒。

今天，筆者就帶大家一同解析來自深圳市第三人民醫院的劉映霞教授、劉磊教授與來自中科院深圳先進技術研究院的李亮教授團隊的對該議題產生的探討。深圳三院在疫情期間，第一時間“全員動員、全域作戰”，在深圳抗疫的戰場中全力投入，更是首次在全國率先從確診患者糞便中檢測出新冠病毒核酸陽性。

本期研究主題：新冠肺炎患者腸道排毒特征規律及不同標本病毒脫落情況研究

鼻咽拭子、口咽拭子、痰液、支氣管灌洗液及肛拭子這些不同類型的標本與檢測結果之間到底存在著什么樣的聯系呢？不同的病程進展情況下，上述各樣本類型是否存在檢出差異？且聽大咖見解，一一道來~

解讀文獻1：《The Time Sequences of Oral and Fecal Viral Shedding of Coronavirus Disease 2019(COVID-19) Patients》

本研究成果由深圳市第三人民醫院的劉映霞教授、劉磊教授和中科院深圳先進技術研究院的李亮教授團隊在2020年5月16日發表于胃腸病學和肝病專業領域國際排名第一的醫學雜志《胃腸病學（Gastroenterology）》，研究主題為新冠肺炎患者的腸道排毒特征及規律。



本研究持續對深圳三院住院的401名實驗室確診的COVID-19患者糞便及呼吸道樣本中的病毒核酸進行監測，跟蹤隨訪長達三個月以上， 研究發現此次SARS-CoV-2在感染早期（病程第1周）從腸道排出的陽性率最高（44.19%），而2003年的SARS病毒在腸道的檢出率通常需要在2~3周時才能達到高峰。隨著病程進展，SARS-CoV-2在糞便中病毒核酸的陽性率逐步下降，在病程的4~5周形成一個平臺期。通過對患者的臨床資料分析，在病程的3~5周時，大部分患者臨床癥狀已消失，各項指標達到了出院標準，但仍有12%的患者糞便可以持續排毒，提示對于康復期患者仍需加強糞便管理，防止糞口傳播。研究發現在病程第7周時仍然有2例患者糞便核酸陽性，但病程7周以上的患者（共篩檢303例）的糞便病毒核酸未再檢出陽性。（見圖1）



圖1. 患者糞便中 SARS-CoV-2在病程不同時間（周）的檢測情況。


研究同時還收集了糞便病毒核酸陽性的患者配對的呼吸道樣本，共517對（同一天采集的糞便和呼吸道樣本），結果發現29.8%(111對)的患者糞便病毒RNA檢測呈陽性，而呼吸道樣本中呈陰性，這表明在呼吸道中病毒被清除后，病毒仍有可能在腸道中復制，仍有可能會發生糞口傳播的風險。當兩類樣本同時陽性時，糞便樣本病毒載量普遍較呼吸道樣本高，提示對糞便樣本的病毒核酸檢測，有助于提高新冠病毒感染的陽性率。

研究還發現兒童新冠感染患者糞便的病毒陽性率遠高于成人，提示要重視兒童新冠病毒感染患者糞便樣本的病毒核酸檢測和管理；同時發現胃腸道癥狀的存在似乎與糞便樣本病毒陽性無相關性，提示新冠病毒可能將腸道作為儲存和復制的場所，但尚未發現其對腸道功能的嚴重影響；此外，患者的中性粒細胞水平與病毒在糞便中持續時間呈正相關，而抗病毒治療啟動時間與病毒在糞便中持續時間呈負相關，提示早期有效抗病毒治療也許能夠縮短SARS-CoV-2在腸道存在時間。


解讀文獻2：Laboratory Diagnosis and Monitoring the Viral Shedding of SARS-CoV-2 Infection


本文由深圳市第三人民醫院國家傳染病臨床研究中心的劉映霞教授團隊通過RT-PCR檢測分析了不同呼吸道標本，并對比了新冠患者上呼吸道和下呼吸道之間的病毒脫落情況的差異。研究對不同時期、不同樣本的病毒載量提供了翔實的研究數據，從而提高了新冠檢測的準確性。


樣本情況：


本期研究收集了410例患者的3,552份呼吸道標本，包括559份口咽拭子，2,231份鼻咽拭子，696份痰標本和66 份支氣管肺泡灌洗液（BALF）樣本。在這些患者中，90例為重癥患者，320例為輕度和中度患者。

圖2. 患者狀況分布圖


不同呼吸道樣本中檢測新冠病原體

本期研究對發病后0-7天，8-14天和15天以上三個時間分別進行了采樣。文章中的每個樣本均采用了上海伯杰醫療科技有限公司的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒（熒光PCR法）進行檢測。結果表明，發病0-7天樣本中，痰樣本的陽性率最高，其次是鼻咽拭子，然后是口咽拭子。在發病8-14天中，痰樣本也顯示出了最高的陽性率。而在15天以后，幾種樣本的陽性率基本持平。在0-7天和8-14天兩組中，重癥患者的支氣管肺泡灌洗液的陽性率為100%，但是輕度患者為陰性。15天后，重癥患者的支氣管肺泡灌洗液的陽性率依舊高達63.8%。并且隨著時間的增長，病毒載量和陽性率會逐漸降低。


上，下呼吸道的不同檢測結果

實驗收集了21名新冠患者的上，下呼吸道樣本。在重癥患者中，RNA病毒能在大部分上呼吸道樣本中被檢測到。支氣管肺泡灌洗液樣本中的RNA病毒最早在第4天被發現，但重癥病例的Ct值較低。盡管病毒RNA在部分上呼吸道樣本中顯陰性，但在支氣管肺泡灌洗液樣本中會顯出陽性。相反，在輕度患者中，僅在上呼吸道檢測出了RNA病毒，而未在支氣管肺泡灌洗液樣本中檢測到。

圖3. RNA病原體的檢測狀況


結論：

1.多種樣本檢測結果互為補充，能夠有效防止漏檢：根據實驗結果，新冠不同疾病程度患者的痰樣本、鼻咽拭子、口咽拭子陽性率不同，痰液的檢出率相對較高。

2.重癥病例上呼吸道樣本檢出率低，需聯合其他輔助手段：經過上，下呼吸道的樣本檢測，一些重癥病例的上呼吸道樣本中未檢測出病毒RNA但在痰液樣本中顯示為陽性。由此可見，盡管未在上呼吸道樣本中檢測到病毒RNA，但不應將那些具有接觸史和臨床癥狀的可疑病例排除。在這種情況下，CT掃描可能為診斷COVID-19提供重要證據。


3.下呼吸道病毒脫落時間更長：研究發現，下呼吸道的病毒脫落時間可持續長達46天，這比先前發現的上呼吸道樣本的病毒脫落時間更長。在制定治療和抗擊病毒傳播的策略時，應謹慎對待新冠病毒的異常病毒脫落情況。

圖4. RNA病毒的脫落持續時長


綜上所述，兩篇文章中均探討了針對不同樣本類型的新冠陽性檢出率。痰液的檢出率相對較高，但是除呼吸道樣本外糞便檢測也可以作為呼吸道樣本檢測很好補充。當下疫情的重點之一，在于篩查出初期及無癥狀感染者，而多樣化的取樣送檢，可以有效地提高檢出率避免漏檢。


本文中所提及的學術研究所使用的檢測試劑，來自于上海伯杰醫療科技有限公司的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒（熒光PCR法）。此番能夠在科研合作中出一份力，伯杰醫療深感榮幸。成立以來，伯杰醫療一直專注于傳染性病原體的診斷，秉承“勇于創新，質量為先”的方針。助力檢驗科研事業的發展，伯杰醫療責無旁貸！


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